Bio-informatique

Présentation

Carte d’identité de la formation

Domaine : Sciences, Technologies, Santé
Mention : Bio-informatique
Discipline : Informatique, Sciences de la vie, Biologie
Public concerné : Formation continue, Formation initiale
Niveau de sortie : Master
Durée : 4 semestres
Crédits : 120 crédits ECTS
Composante : UF Biologie
Site de formation : Campus Pessac, Campus Talence
Responsable(s) de la formation : Jean-Christophe Taveau

Objectifs et compétences

La mention bioinformatique forme des ingénieurs en bioinformatique dans les secteurs académiques et industriels .

Les compétences acquises au cours de cette formation permettront de faire face aux défis de la biologie 2.0 avec les nouvelles technologies de production de données du vivant à haut débit. Il s'agit donc d'acquérir une double compétence en informatique (algorithmique et programmation) et biologie de manière à faire des étudiants de biologie des utilisateurs avancés (développement logiciel et analyse experte de données) du génome aux écosystèmes.

Les différents parcours proposés par la mention permettent à l'étudiant de choisir le domaine d'applications - Santé, Agrosciences, Environnement - dans lequel il souhaite définir son futur profil professionnel.



En savoir plus :
Consultez les statistiques de recrutement en master 1 : cliquez ici


Compétences à acquérir :

  • Travailler en équipe dans différents contextes, y compris avec des personnes issues de disciplines différentes : s'intégrer, se positionner, collaborer, communiquer et rendre compte.
  • Etre capable de mettre en œuvre des outils bio-informatiques et des banques de données pour la modélisation de processus biologiques et pour l’étude de l’évolution des molécules et des organismes.
  • Connaître les principes de base de l'algorithmique
  • Maîtriser un ou plusieurs langages de programmation pour l'appliquer aux domaines des sciences du vivant (statistiques, bases de données, imagerie, modélisation).
  • Savoir mettre en œuvre une méthodologie: choisir la meilleure stratégie, construire un protocole analytique, identifier les sources d’erreur, analyser et interpréter les données.

Recherche

Sur le campus de l'université de Bordeaux, il y a une présence significative de laboratoires de recherche en biologie, informatique et imagerie en microscopies.
Le master se situe à l'interface de ces disciplines et s'appuie sur un fort potentiel d'EC et de chercheurs émanant de ces laboratoires. La bioinformatique à l'heure actuelle concerne autant la gestion de données, la modélisation des systèmes du vivant et l'analyse d'images que l'analyse des écosystèmes. Tous ces domaines sont très largement représentés par les entités de recherche du campus (LaBRI, CBMN, INRA).

International

Autre accord européen ou international : The BAO (Bioinformatics And Omics) international program is both based on the experience of metagenomics data of the UPV/EHU (University of Bilbao, Spain), and the experience in training bioinformatics to biologists of the Master of Bioinformatics of Bordeaux University. The BAO master is a two-year post-graduate Master program, entirely taught in English, and designed to the new challenge of analysing complex “omics” data at the interface of Bioinformatics. The revolution in high-throughput sequencing technologies has enabled the acquisition of gigabytes of data sequences and entailed to meet new challenges in the new era of “omics» data. To perform the exploitation and analysis of these data, the contribution of Bioinformatics is essential and impacts the practices in training the future biologists. Their skills have to evolve towards a good level of computer ability to use relevant software applications dedicated to the “omics” data while enhancing their understanding of life science. In this context, the master of Bioinformatics of the university of Bordeaux and the “Titulo propio” « Bioinformatics and Omics » of the UPV/EHU proposes an International Master's Program dealing with the combined training of metagenomics and Bioinformatics.

Stage à l'étranger ou semestre de mobilité : Les étudiants réaliseront leur stage dans un des domaines de la biologie adressant la bioinformatique: génomique, métabolomique, écologie, imagerie ..... ils seront évalués par leur maitre de stage et par l'équipe pédagogique du master au travers d'un rapport de stage et d'une soutenance.

Autre dispositif d'internationalisation : Au delà du parcours international "Bioimages, structures and contents" qui par nature est international, les étudiants peuvent souscrire au programme Erasmus et aller suivre un semestre dans un pays partenaire.

Informations complémentaires

Organisation

Contenu de la formation

Modalités et contrôle des connaissances

En cours de finalisation

Débouchés

Poursuite d'études

  • Doctorat

Débouchés professionnels / Métiers

Codes ROME:

  • H1206 - Management et ingénierie études, recherche et développement industriel
  • H1402 - Management et ingénierie méthodes et industrialisation
  • M1805 - Études et développement informatique
  • M1810 - Production et exploitation de systèmes d'information
  • M1801 - Administration de systèmes d'information
  • M1802 - Conseil et maîtrise d'ouvrage en systèmes d'information
  • K2108 - Enseignement supérieur
  • K2402 - Recherche en sciences de l'univers, de la matière et du vivant
  • M1808 - Information géographique
  • A1204 - Protection du patrimoine naturel

Secteurs d'activités

  • Industrie
  • Support à l'entreprise
  • Services à la personne et à la collectivité
  • Agriculture et pêche, espaces naturels et espaces verts, soins aux animaux

Admission

Conditions d'admission

L’accès à la première année de Master est ouvert aux candidats titulaires du diplôme national de licence ou après validation d'un diplôme du domaine correspondant.

Licence conseillée :

Licence mention Sciences de la vie et de la terre

L’admission dans cette formation soumise à capacité d’accueil se fait sur examen de dossier du candidat conformément à la délibération n°2017-12 du conseil d’administration

https://www.u-bordeaux.fr/content/download/56422/424525/version/1/file/2017-12_D%C3%A9lib_admission%20M1.pdf

L'accès en deuxième année est ouvert aux candidats titulaires de 60 crédits du Master ou après validation d'un diplôme du domaine correspondant.

Étudiants titulaires d'un titre d'accès ou en cours de cycle à l'étranger, toutes les informations sur la page dédiée du site de l'université de Bordeaux.

  • Première année - parcours Biologie computationnelle : cliquez ici
  • Deuxième année - parcours Biologie computationnelle : cliquez ici
  • Première année - parcours Du génome aux écosystèmes : cliquez ici
  • Deuxième année - parcours Du génome aux écosystèmes : cliquez ici

Contact

Formulaire de contact

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master.bioinfo.bordeaux@gmail.com


Jean-Christophe Taveau


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